瑶族医药从文物考古中也有力地证明她的历史源远流长。如在长沙东郊发掘的马王堆出土的至今发现的最古老的医学帛书《五十二病方》记载有瑶族特色的熏洗方八首。熏蒸疗法是用烟雾、蒸气、药液温熏或淋洗肌肤与灵窍的一种古代疗法。它具有发汗、透疹、祛风、开窍、解毒、杀虫、补虚和止痛等功效。《五十二病方》中还有关发泡药罐的记载。发泡药罐疗法属拔罐法，古称角法。曾任广西勾漏令（现北流县）的葛洪，在其所著《肘后方》中，总结了广西瑶族等民间各种角法，为广西各民族开展角法起到了积极的推动作用，至今北流县仍有葛仙翁丹灶遗址。

而在湖南省的江华瑶族自治县沱江一带出土的东江墓葬遗物中，发现了一些芳香性药物，大多是一些挥发油类的化学成分。瑶族先民很早就以佩戴此类药物来辟秽、避免传染疾病，这在瑶族中叫“药佩”，是将一些含有芳香性、挥发性药物装入饰物中，即做成了药佩，这些药物的有效成分如挥发油类成分，可徐徐散发出来，经肺的呼吸，进入气血循环，对心、肝、肺及一些脏腑器官起作用，有芳香辟秽、祛邪解毒、清热消肿、散风止痒和安神定志的功效。主要用于感冒、瘟疫、邪毒、风疹、瘿肿等病症。药物有白芷、辛荑、藿香、薄荷脑、冰片等，具有通窍、散结、消炎、抗菌之功效。可见在那时就有了丰富的用药经验和讲卫生、预防传染病的良好习惯，并用这些药做随葬品以做皮肤消毒、防腐杀菌。

1976年，广西考古工作者发现贵县罗泊湾一号墓有七个殉葬人，经鉴定，均无伤痕及骨折，其死因可能是毒杀。这就是当地瑶族地区使用毒药杀人的例子。瑶族地区毒药很多，据广西地方文献和中草药普查的资料记载就有：砒霜、铅粉、鸦片、苦刎、羊角扭、断肠草、野菊、曼陀罗花等。瑶族人民认识了毒药，同时也探索、总结出了解毒药。如用甘蔗、猪腰子、山狭骨等解箭毒；用黄藤、壅菜汁、山豆根、黄连、芭蕉根等解诸药毒；用钩吻、黄药子、蜈蚣等解虫毒及蛊毒；用橄榄、白豆蔻、白葡萄等食物中毒；用甘草、白花藤、金钗股等解诸毒。